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BioNumerics(生物数据信息综合分析平台)
 

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    随着生命科学领域越来越多的对表型,基因型,电泳图,序列信息等各种数据的整合的需求, 研究者们遭遇了两个最主要的问题: (1) 对各种不同类型的高通量的数据的存储和查询, (2) 基于这些不同类型的数据对不同的物种或样本的研究,分析和比较。 一方面对凝胶谱, 表型数据, 基因芯片及序列都有各自的特异的独立软件来分析, 另一方面, 需要存储大批量数据的强大的数据库系统。 同时, 需要一些通用的数学分析的方法来对数字信息进行比较分析。 所有的这些都是生物信息学所研究的复杂的问题中的一部分。 基于上面的需求, 我们需要一套可以整合上面的各种软件系统, 能够以生物学的各种试验数据作为输入数据, 以强大的整合数据库为中心,对生物学数据进行比较,分析,研究的系统。 BioNumerics正是为此应运而生的一套系统, 它很好的满足了研究机构或诊断机构对不同的生物学数据的比较分析的要求。 这套软件系统已经得到了很多研究机构, 包括大学, 医院, 公共医疗中心, 食品,药物和制药企业以及广泛的联邦及私人的关于质量控制, 筛选, 测试, 饲养等各种实验室的广泛的认可。

概念
BioNumerics的特性之一是包含了一个整合了针对于各种现有的生物学数据的分析模块的关系型数据库。 本系统除了提供了强大的, 对输入数据的类型和大小没有限制的多用户的环境, 同时提供了现有最先进的对凝胶图谱, 指纹图谱, 序列信息等的分析工具。 数据库里面的数据记录, 可以是细菌或者是病毒菌株, 动物, 植物, 真菌, 或任何器官的指纹图谱样本。 同时, 不同的试验方法来的样本也可以定义在同一个数据库的记录中。 利用本系统, 用户可以对多种试验数据的不同的记录之间进行研究比较, 并对不同的记录通过整合进行分类鉴定。
根据所有现有可能的生物学试验, 试验数据可以分为以下五类: (1) 1-D电泳图谱, 称为"指纹"类型, (2) 基于特征的数据, 称为特征字符类型, (3) DNA, RNA 和蛋白序列, 称为序列类型, (4) 2-D电泳胶, 称为2-D胶类型, (5) 矩阵类型。 在上面的每种试验类型中, 用户可以设定特定的参数修改自己的试验类型。 上述五种试验类型是BioNumerics系统的模块分类的基础。

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